Sans annuaire des entreprises bien configuré, la facture électronique se bloque. Pour le transport et la logistique, c’est aussi le socle des futurs usages d’IA.

Pourquoi l’annuaire des entreprises devient stratégique pour le transport
À partir du 01/09/2026, toute entreprise assujettie à la TVA devra être capable de recevoir des factures électroniques. Dans le transport et la logistique, où les flux de factures se comptent souvent en milliers par mois (carburant, péages, sous-traitants, manutention, locations, entreposage…), ce n’est pas un simple détail administratif : c’est un sujet de continuité d’activité.
Voici le point souvent sous-estimé : sans inscription correcte dans l’annuaire des entreprises, la facture électronique ne circule pas. Peu importe la qualité de votre TMS, de votre WMS ou de vos outils d’IA : si la facture ne trouve pas sa « voie officielle », elle est bloquée.
Pour les directions financières, les DAF de groupes de transport, mais aussi pour les experts-comptables qui accompagnent le secteur, l’annuaire n’est pas un gadget. C’est le socle technique qui conditionne la réussite de la facturation électronique… et donc l’exploitation réaliste de l’IA pour automatiser la comptabilité, analyser la rentabilité par ligne ou optimiser la trésorerie.
Dans cet article, on va voir :
- ce qu’est concrètement l’annuaire des entreprises et son rôle dans la facture électronique,
- comment SIREN, SIRET et codes internes structurent vos circuits de facturation,
- comment un cabinet d’expertise comptable peut piloter ce chantier pour ses clients transport et logistique,
- et surtout comment tout cela prépare le terrain à l’IA appliquée à la finance et à la logistique.
1. L’annuaire des entreprises : le GPS officiel de la facture électronique
L’annuaire des entreprises est la base de données centralisée gérée par l’État qui indique, pour chaque entreprise :
- quel est son SIREN (identifiant racine),
- quelle est la plateforme agréée (ex-PDP) qu’elle a choisie pour envoyer / recevoir ses factures électroniques,
- éventuellement, à quel niveau de granularité (SIREN, SIRET, code interne) elle souhaite recevoir les factures.
Pour le dire simplement : une facture électronique ne part jamais « en direct » de fournisseur à client. Elle circule via une plateforme agréée ou le portail public, et c’est l’annuaire qui indique la bonne « adresse de destination ».
Dans le transport et la logistique, cela évite par exemple :
- des factures de carburant perdues pour un dépôt,
- des factures de sous-traitance affectées au mauvais établissement,
- des litiges de facturation parce que la facture n’est jamais arrivée sur la bonne plateforme.
Sans annuaire à jour, vous créez un goulot d’étranglement numérique. Les flux physiques de marchandises avancent, mais les flux financiers restent bloqués.
Ă€ partir du 01/09/2026 :
- toutes les entreprises doivent pouvoir recevoir des factures électroniques,
- ce qui implique d’avoir choisi une plateforme agréée et d’être correctement référencées dans l’annuaire.
Pour un cabinet d’expertise comptable : ne pas anticiper ce point pour ses clients, c’est accepter un risque très concret de blocage de factures, de tensions de trésorerie et de surcharge de support.
2. SIREN, SIRET, codes internes : bien choisir sa « maille » de réception
Le numéro SIREN est la clé d’entrée de l’annuaire. C’est lui qui identifie formellement l’entreprise destinataire de la facture.
À partir de là , chaque entreprise de transport ou de logistique a trois options pour organiser la réception de ses factures :
2.1 Niveau SIREN : tout au siège
Toutes les factures sont adressées au SIREN, donc à une seule entité de réception.
Intérêt :
- modèle simple à gérer,
- adapté aux TPE/PME de transport avec une structure centralisée,
- contrôle facilité par le cabinet comptable ou la direction financière.
Limites :
- moins de finesse dans l’affectation des coûts dès l’entrée,
- nécessité de retraiter ensuite par établissement ou activité (navette, messagerie, lot, affrètement…).
2.2 Niveau SIRET : chaque site, dépôt ou entrepôt reçoit ses factures
Ici, chaque établissement (SIRET) est destinataire des factures qui le concernent.
Intérêt pour le transport/logistique :
- idéal pour les réseaux multi-agences, multi-dépôts,
- meilleure visibilité des coûts par site : carburant, loyers d’entrepôt, manutention, sous-traitance locale,
- plus simple à corréler avec des indicateurs logistiques (coût par colis, par tournée, par palette…).
Exigence forte :
- avant de facturer, il faut savoir quel établissement a passé commande (agence émettrice, dépôt concerné, entrepôt d’expédition),
- les process commerciaux, transport et finance doivent être alignés, sinon les erreurs de destination se multiplient.
2.3 Code interne : affiner jusqu’au service ou à la ligne d’activité
Dernier niveau : utiliser un code interne rattaché à un service ou à une unité (ex. « Exploitation messagerie Lyon », « Affrètement international », « Entrepôt e-commerce »).
Intérêt :
- permet une affectation des coûts extrêmement fine :
- par activité (messagerie, lot complet, température dirigée…),
- par grand compte,
- par entrepĂ´t ou cellule logistique,
- alimente directement les modèles d’IA de contrôle de gestion (marges par activité, rentabilité d’une ligne, optimisation du réseau).
Contrepartie :
- nécessite une gouvernance de données solide,
- il faut que les clients et les fournisseurs connaissent ce code à l’avance,
- le risque d’erreur d’adressage augmente si la maîtrise n’est pas parfaite.
Pour un expert-comptable spécialisé transport, le rôle consiste souvent à :
- cartographier les flux : qui commande quoi, pour quel site, pour quel client final,
- recommander une maille de réception adaptée :
- SIREN pour les petites structures,
- SIRET pour les réseaux régionaux/nationaux,
- codes internes pour les groupes intégrés avec forte maturité data,
- et documenter ces choix dans une note de procédure partagée avec les opérationnels.
3. Comment figurer (correctement) dans l’annuaire des entreprises
La bonne nouvelle : toutes les entreprises assujetties à la TVA sont déjà authentifiées dans l’annuaire au niveau SIREN. Le cœur du sujet n’est donc pas « y être », mais y être correctement configuré.
L’annuaire est géré par l’Agence pour l’Informatique Financière de l’État. Deux informations sont essentielles pour la facture électronique :
- la plateforme agréée choisie pour transmettre et recevoir les factures ;
- la maille de réception (SIREN, SIRET, codes internes) pour déposer la facture au bon endroit.
3.1 La responsabilité de l’entreprise… et l’opportunité pour l’expert-comptable
L’association plateforme agréée / SIREN relève exclusivement de l’entreprise. C’est une démarche volontaire, réalisée lors de la déclaration de son choix de plateforme.
Concrètement, cela signifie que l’expert-comptable peut :
- conseiller sur le choix de la plateforme agréée, en fonction du SI existant (ERP, TMS, WMS, logiciels comptables),
- sécuriser la démarche de déclaration,
- auditer la cohérence annuaire ↔ organisation interne :
- les SIRET renseignés correspondent-ils bien aux sites actifs ?
- les codes internes envisagés sont-ils compris par les équipes ?
Ă€ partir du 01/09/2026 :
- pour recevoir des factures électroniques, une entreprise devra au minimum :
- figurer dans l’annuaire (SIREN a minima),
- avoir indiqué sa plateforme agréée.
- pour émettre des factures, un fournisseur devra :
- vérifier que son client est conforme dans l’annuaire,
- disposer des bons identifiants (SIRET ou code interne si nécessaire).
Un transporteur qui ne valide pas la configuration de ses grands donneurs d’ordre dans l’annuaire prend un risque clair : ne pas pouvoir facturer ses prestations dans les délais.
3.2 Check-list opérationnelle pour le secteur transport/logistique
Voici une trame que j’utilise souvent dans les missions de préparation facture électronique pour des groupes de transport :
- Lister toutes les entités juridiques (SIREN) et établissements (SIRET) du groupe.
- Identifier les flux de facturation :
- clients grands comptes,
- sous-traitants transport,
- prestataires logistiques,
- carburant, péages, locations, manutention, intérim…
- Décider de la maille de réception pour chaque entité : SIREN, SIRET, code interne.
- Choisir la plateforme agréée en cohérence avec :
- l’ERP / logiciel comptable,
- le TMS et éventuellement le WMS,
- les outils d’IA ou d’analytique que l’on souhaite déployer.
- Déclarer le choix de plateforme et vérifier la mise à jour de la fiche dans l’annuaire.
- Communiquer les identifiants (SIREN/SIRET/codes internes) Ă :
- tous les fournisseurs récurrents,
- les grands clients, pour sécuriser les sens aller/retour.
- Mettre à jour les documents commerciaux : CGV, conditions de facturation, bons de commande, afin d’intégrer les nouvelles règles.
Ce type de démarche est parfait pour un offre packagée de cabinet ciblant le transport/logistique : audit, paramétrage annuaire, choix de plateforme, mise à jour documentaire et formation.
4. Pourquoi cet annuaire est aussi le socle de l’IA financière dans le transport
Voici le lien direct avec notre série « L’IA dans le transport et la logistique en France » :
pas de données propres, structurées et fiables, pas d’IA utile.
L’annuaire des entreprises, combiné à la facture électronique, crée justement :
- des données normalisées : mêmes formats, mêmes champs, mêmes identifiants ;
- des flux continus : plus de factures papier perdues dans les agences ;
- des référentiels stables : SIREN/SIRET/codes internes alignés sur les outils métiers.
Une fois ce socle posé, les usages IA deviennent crédibles :
- Analyse de rentabilité par tournée ou par ligne : en rattachant chaque facture de péage, carburant, manutention au bon établissement ou code interne.
- Prévision de trésorerie plus fine : l’IA apprend sur les délais de règlement par client, par type de prestation, par plateforme.
- Détection d’anomalies de facturation : doublons, écarts systématiques, sur-facturation sur certains postes.
- Pilotage des sous-traitants : comparaison en temps réel des coûts facturés vs contrats, par type de flux et par région.
Pour un expert-comptable, c’est le moment de changer de posture :
- ne plus être seulement le garant de la conformité fiscale,
- devenir l’architecte des données financières prêtes pour l’IA.
Et tout commence par une chose très « low-tech » en apparence : bien travailler son inscription dans l’annuaire des entreprises.
5. Plan d’action immédiat pour experts-comptables et dirigeants transport
La réalité est simple : ceux qui anticipent en 2025–2026 feront de la facture électronique un avantage compétitif. Les autres subiront.
Pour un cabinet d’expertise comptable positionné sur le transport et la logistique, je recommande :
- Segmenter son portefeuille : repérer tous les clients concernés par la facture électronique, avec un focus sur :
- transporteurs routiers,
- logisticiens, entrepĂ´ts, 3PL/4PL,
- messagerie, express, entreprises multi-agences.
- Proposer un bilan express « annuaire & e-facture » :
- maille de réception recommandée,
- état des lieux SIREN/SIRET,
- premiers impacts sur les outils et procédures.
- Construire une offre packagée :
- mise en conformité annuaire + choix plateforme agréée,
- paramétrage du logiciel de facturation et de comptabilité,
- préparation aux futurs usages IA (tableaux de bord, prévisions, marges par activité).
- Former les interlocuteurs métiers (direction d’exploitation, responsables d’agence, responsables entrepôt) :
- comment identifier le bon SIRET / code interne,
- comment vérifier un client dans l’annuaire avant devis / contrat.
Pour un dirigeant de groupe de transport ou un directeur financier :
- bloquer du temps dès maintenant avec son expert-comptable pour sécuriser annuaire + plateforme agréée ;
- arbitrer la maille de réception en cohérence avec la stratégie : centralisation vs pilotage fin par site / activité ;
- intégrer la facture électronique et l’annuaire dans la feuille de route IA et digitalisation de l’entreprise.
La facture électronique n’est pas qu’une nouvelle contrainte réglementaire. Pour le transport et la logistique, c’est une opportunité rare de fiabiliser les données financières à la source et d’ouvrir la voie à une IA vraiment utile.
Au 01/09/2026, toutes les entreprises assujetties à la TVA devront être référencées et configurées dans l’annuaire des entreprises avec une plateforme agréée. Celles qui auront organisé intelligemment leurs SIREN, SIRET et codes internes disposeront d’un avantage clair : des flux de facturation fluides, des données propres et des fondations solides pour l’IA de gestion appliquée au transport et à la logistique.
La vraie question est donc simple : voulez-vous subir l’annuaire comme une contrainte ou l’utiliser comme point de départ pour une finance augmentée à l’IA dans votre entreprise de transport ?